衣原體為革蘭氏陰性病原體，是一類能通過細菌濾器、在細胞內寄生、有獨特發育周期的原核細胞性微生物。衣原體廣泛寄生于人類、鳥類及哺乳動物。僅少數有致病性，能引起人類疾病的有沙眼衣原體、肺炎衣原體、鸚鵡熱肺炎衣原體。
衣原體對熱敏感，在60℃僅能存活5～10分鐘。衣原體耐冷，在-70℃可保存數年，冷凍干燥可保存30年以上。常用消毒劑也能迅速殺滅衣原體，如75%乙醇0.5分鐘或2%來蘇液5分鐘均可將其殺死。紅霉素、強力霉素和四環素等有抑制衣原體繁殖的作用。
衣原體感染的癥狀：
1、男性衣原體性尿道炎
男性衣原體性尿道炎又稱為非淋菌性尿道炎（NGU），是由衣原體感染引起的非急性化膿性尿道粘膜炎性病變。
本病潛伏期比淋病長，約1-3周或數月，主要表現為尿道內不適，刺痛及燒灼感，并伴有不同程度的尿頻，尿急，尿痛，尿痛較淋病為輕，尿道口輕度紅腫并有漿液或粘液膿性分泌物，稀薄而量少，長時期不排尿或早晨首次排尿前可見尿道口分泌物污染內褲，并可見尿道口有“糊口”現象；分泌物少時，于晨起擠壓尿道才流出少量粘液。
沙眼衣原體感染易并發附睪炎，表現為附睪腫大，變硬及觸痛，多為單側，部分患者的抗沙眼衣原體抗體升高，可直接從附睪抽吸液中分離出沙眼衣原體；累及睪丸可出現睪丸炎，表現為睪丸疼痛，觸痛，陰囊水腫及輸精管變硬變粗。
累及前列腺時可出現后尿道，會陰及肛門部位鈍痛或觸痛，可有性功能障礙，直腸鏡檢可觸及有壓痛的前列腺，如前列腺明顯腫大，可壓迫后尿道而出現尿流變細，排尿無力及尿流中斷等；本病還可以合并Reiter綜合征，即關節炎，結膜炎，尿道炎三聯癥。
2、女性生殖系統衣原體感染癥
女性感染衣原體不限于尿道，可累及整個泌尿生殖器官，此類感染常因缺乏自覺癥狀或癥狀輕微而忽視了治療，造成傳染源而擴散，形成危害。
女性衣原體感染比男性感染引起的癥狀要多，其主要感染部位為宮頸，其后遺癥多導致不孕癥。
衣原體感染的危害：
1、衣原體屬中被確認的有3個種：導致鸚鵡熱的鸚鵡熱衣原體，導致衣原體肺炎的肺炎衣原體和沙眼衣原體。沙眼衣原體包涵15個血清型，可導致很多疾病。血清型A,B,Ba和C導致沙眼和包涵體結合膜炎；D至K型導致性傳染疾病；L1和L2型導致性傳播疾病淋巴肉芽腫；L3型導致小鼠肺炎。
2、沙眼衣原體是美國性傳染疾病最通常的病原體，包涵男性的非淋菌性尿道炎和附睪炎；女士的子宮頸炎，尿道炎和盆腔炎癥性疾病；Reiter綜合征；新生兒結膜炎以及通過母親傳染而獲的肺炎。20%的成人咽炎歸因于沙眼衣原體。
3、肺炎衣原體原先以為是鸚鵡衣原體的一種血清型，現在以為是一獨立的種，可導致肺炎，特殊多見于兒童和青年景人。各家研究表明，社人群獲得的肺炎中由肺炎衣原體導致的占6%~19%。但在臨床上不能與支原體導致的肺炎差別。
4、當然有的研究以為5歲以下兒童的衣原體肺炎不通常，但有的研究指出6%~9%的病例由衣原體所致，未發現發作有季節差異。在動脈粥樣硬化的病變發現有衣原體，因此衣原體被傳染與冠心病危險性增高相關，但因果聯系尚未明確，治療試驗尚在進行中。
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