常見癥狀：惡寒、發熱、腹絞痛、氣脹、惡心、嘔吐
沙門氏菌感染的臨床表現多種多樣，按其主要癥候群，可分為腸炎型、傷寒型、敗血癥型和局部化膿性感染四型。
一、腸炎型(食物中毒)
是沙門氏菌感染最常見的形式，潛伏期一般為8～24小時。起病急驟，常伴有惡寒、發熱，但熱度一般不甚高，同時出現腹絞痛、氣脹、惡心、嘔吐等癥狀。繼而發生腹瀉，一天數次至十數次或更多，如水樣，深黃色或帶綠色，有些有惡臭。糞便中常混有未消化食物及少量粘液，偶帶膿血，當炎癥蔓延至結腸下段時，可有里急后重。病程大多為2～4天，有時持續時間較長。鼠傷寒沙門氏菌感染時，以腹瀉、高熱為主，膿血便多見;成人高熱較少，熱程較短，腹痛及里急后重較多，而兒童高熱較久，嘔吐及脫水較多。
偶有呈霍亂樣暴發性胃腸炎型者，病人嘔吐和腹瀉均劇烈，體溫在病初時升高，立即下降，脈弱而速，可出現嚴重脫水、電解質紊亂、肌肉痙攣、尿少或尿閉，如搶救不及時，可于短期內因急性腎功能衰竭或周圍循環衰竭而死亡。
二、傷寒型
非傷寒沙門氏細菌感染時，可引起類似傷寒的臨床表現，其中以豬霍亂菌較常見。癥狀一般較傷寒輕，長期發熱，伴胃腸道癥狀，或以胃腸炎為前驅表現，皮疹少見，腹瀉較多，可見脾腫大，白細胞總數低下，而腸穿孔、腸出血等并發癥少。病程大多僅1～3周，血和糞便培養可獲有關沙門氏菌。復發機會比傷寒多。
三、敗血癥型
在免疫功能正常的宿主中，沙門氏菌感染引起敗血癥的機會不到10%，而艾滋病(AIDS)可高達45%。敗血癥型患者約有1/3～1/2有肝硬化、系統性紅斑狼瘡、白血病、淋巴瘤或新生物等原發病，預后較差。本型以長期發熱為主要特征，體溫可高達40℃以上，呈不規則熱(弛張熱或間歇熱)，伴反復寒戰、出汗、頭痛、惡心、厭食、體重下降，部分患者有胃腸炎癥狀，偶見脾腫大，約1/4患者在病程中出現局部感染病灶，以骨關節最常見，且可累及多關節，遷延不愈，形成瘺管。新生兒、嬰兒的腦膜易受侵犯，病死率可高達80%以上，其他尚有支氣管肺炎、肺膿腫、胸膜炎、膿胸、心包炎、心內膜炎、腎盂腎炎等。
四、局部化膿性感染
可發生于任何部位，但好發于縫線處、骨折處、組織器官移植處、動脈粥樣硬化斑處以及有腫瘤處等原先有病變，或活力不強的部位。本型無胃腸炎或全身癥狀，僅有膿腫形成，并呈慢性化傾向，需靠病原菌檢查以明確診斷。
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