慢性胃炎是由多種原因引起的胃粘膜慢性炎癥性病變，目前引發慢性胃炎的病因尚未完全弄清，就已知的病因簡述如下。
1、胃粘膜損傷因子：外源性諸因子，如機械性、溫度、化學性、放射線和生物性因子長期反復損傷胃粘膜，造成炎癥持續不愈，例如攝食粗糙食物、酗酒、服用非甾體類抗炎藥、口咽部慢性感染灶等等。內科某些疾病，如右心衰竭、肝硬化門脈高壓引起的胃粘膜瘀血缺氧，尿毒癥時血尿素氮升高都可引起胃粘膜對刺激物耐受性降低，使其易于損傷。
2、幽門螺桿菌感染：近些年研究發現慢性胃炎的發生發展與幽門螺桿菌感染有很大關系。根據其流行病學研究。成人感染率為50%以上，胃竇炎患者陽性率一般為70%～90%。如何根治幽門螺桿菌且防止其復發是慢性胃炎治療中的關鍵一步。
3、十二指腸液返流：十二指腸內容物主要有膽汁、腸液和胰液，它們能減弱胃粘膜屏障功能，使H+反彌散入胃粘膜內，從而發生炎癥、糜爛和出血等，使慢性炎癥持續存在；而慢性炎癥又使屏障功能進一步降低，造成惡性循環，此是慢性胃炎難治的原因之一。
4、年齡因素和胃粘膜營養因子缺乏：慢性胃炎的發病率隨年齡而增加，腸化和萎縮性改變及幽門腺化生也隨年齡而程度加重并范圍擴大，胃粘膜營養因子缺乏可引起胃粘膜萎縮，這些都是老年人發生萎縮性胃炎的重要因素。
5、遺傳因素：經調查驗證，惡性貧血家庭成員中，萎縮性胃炎、維生素B12吸收不良、低酸的患病率和PCA、IFA的陽性率均很高，提示有遺傳因素的影響。
6、免疫因素：免疫因素與萎縮性胃炎關系最為密切。以胃體萎縮為主的慢性胃炎，壁細胞顯著減少，粘膜固有層可發現大量淋巴細胞浸潤，在其患者血清中可檢測出壁細胞抗體（PCA）和內因子抗體（IFA），提示其發病機理與自身免疫有關，此病發展的嚴重后果是胃萎縮伴惡性貧血，而惡性貧血是自身免疫性疾病。
